1990 5 ноября проводится собрание по учреждению АО «EKE Merko». EKE Merko выкупает имущество и обязанности EKE MRK.

1992 EKE Merko переезжает в новую главную контору и производственные здания в Сауе в Харьюском уезде.

1995 EKE Merko заканчивает строительство колоссального нового главного здания Хансабанка в Таллинне и становится одной их крупнейших строительных фирм в Эстонии.

1996 Предприятие исключает все виды деятельности, несвязаные со строительством. Официальное наименование фирмы изменено на АО «Merko Ehitus».

1997 Проводится первоначальная публичная эмиссия акций, предшествующая котировке в основном списке Таллиннской биржы ценных бумаг 22 июля. Торговля акциями фирмы ведется также на биржах Мюнхена и Франкфурта-на-Майне.

1998 Merko Ehitus приобретает контрольный пакет акций в дочерних предприятиях ТОО «Matek», АО «Merko Tartu», UAB «Merko Statyba» (100%) в Литве и SIA «Merks» (100%) в Латвии. Оборот предприятия достигает 843 миллионов крон, что возводит его в ранг самой крупной строительной фирмы Эстонии, а также Прибалтики.

1999 Завершается строительство главной конторы Eesti Ühispank и торгового центра «Кристийне», расширяется круг коммерческой деятельности в Латвии и Литве. От концерна отделяется АО «E.L.L Kinnisvara» с целью разграничения проектов по развитию недвижимости от строительных. Merko Ehitus концентрируется на развитии услуг генерального подряда и управлении проектами, а также создании необходимых рабочих мест. К работе приступает инженерно-строительный дивизион, занимающийся портами, объектами переработки отходов, дорогами, мостами, водопроводными и канализационными трассами и т.д. Предприятию присуждается международный стандарт качества ISO 9001.

2000 В Эстонии построен торговый центр «Сикупилли» и отель «Radisson SAS», в Риге реконструирован Grand Palace Hotel, возводятся производственные здания пивного завода «Cēsu Alus» в Латвии и главное здание телекоммуникационной компании «Lietuvos Telekomas» в Литве. В Эстонии в плане инженерного строительства сооружена свалка в Вяэтса, также реконструируется система водоснабжения Йыхви-Ахтме и сооружения для очистки вод в Курессааре, Валга и Пярну. Оборот Merko Ehitus превышает миллиард крон.

2001 В связи с ростом рыночного спроса на односемейные дома и квартиры в Merko Ehitus формируется дивизион жилищного строительства. Готовы такие значительные объекты, как многоквартирные дома на улице Туви и индивидуальные дома в районе Теэлахкме. Предприятие приобретает 100-процентную долю участия в АО «Tallinna Teed» («Таллиннские Дороги»), в результате чего расширяет портфель услуг в сфере управления проектами по ремонту дорог и их непосредственному ремонту.

2002 В число крупных объектов входит расширение торгового центра Кристийне, строительство супермаркета «Citymarket» в Хааберсти и торгового центра «Norde Centrum». Начаты работы по воздвижению торгового центра «Мустакиви» и торгового делового центра на площади Виру в Таллинне, а также главного здания Хансабанка в Риге.

2003 Yчреждение дочернего предприятия ТОО «Gustaf Tallinn», приобретение 100-процентной доли участия в ТОО «Woody», учреждение дочерних предприятий SIA «Merks» и UAB «Merko Statyba». Заключены новые широкомасштабные договоры о строительстве угольного терминала в порту Мууга и Эстонского художественного музея. Реконструирован некогда представительный отель «Lietuva» в Вильнюсе.

2004 В самом сердце Таллинна завершено строительство центра «Виру», а в Риге - новое здание Хансабанка. SIA «Merks» приступает к сложнейшему проекту разработки - строительству центра досуга «Riga Arena» в Риге. В Эстонии из наиболее крупных объектов закончено строительство Пярнуского отеля-аквапарка и отеля «Tallink City».

2005 Отчуждение дочернего предприятия ТОО «Merko Kaevandused». Наиболее крупными завершенными строительными объектами в Эстонии становятся Эстонский художественный музей (KUMU), многоквартирный дом на бульваре Рявала, производственное здание АО «Wendre», угольный терминал Мууга и здание коммерческого и жилого назначения «Admirali maja». Заключен договор о расширении и реконструкции Тартуской водопроводной и канализационной сети, а также подписан договор с Таллиннским портом о возведении глубоководного порта на острове Сааремаа. В столице Латвии Риге завершен II этап строительства торгового центра «Spice». В Литве в центре города Шяуляй начато строительство торгового центра.

2006 В результате совместных усилий SIA «Merks» и Merko Ehitus в начале года в районе улицы Сканстес завершено строительство мультифункционального центра досуга на 12 000 мест, вслед за которым начинается работа над проектом постройки четырех 24-этажных многоквартирных домов. Наиболее крупные из завершенных объектов - здание школы в Виймси, глубоководный порт на острове Сааремаа, офисное здание Банка Эстонии, многоквартирные дома в центре Табасалу, II этап строительства Таллиннской свалки, комплекс муниципальных домов в поселке Иру и водопроводные и канализационные трассы города Валга. Начато строительство порта Скулте и моста Мурьяни. В Литве в Вильнюсе заложен краеугольный камень торгового центра «Панорама» - самого широкомасштабного строительного проекта концерна за всю его историю.

2007 Построены здание коммерческого назначения Сыпрусе, жилой дом Торнимяэ, отели «Hotell Tallink SPA» и «Nordic Hotel Forum». В строительстве жилых помещений был закончен новый дом на бульваре Сыпрусе, а также завершен II этап строительства домов рядовой застройки и многоквартирных домов в районе Ряэгу-Кянну. В плане инженерного строительства сооружены продление дороги Смуули и транспортная развязка Пуурмани. Арочный мост транспортной развязки Пуурмани был признан победителем конкурса Союза бетона Эстонии «Бетонное строение года 2007». В Латвии в ходе I этапа реконструирован южный мол порта Скулте. Из числа наиболее крупных объектов построены дом мебели около торгового центра «SPICE», современный офисный комплекс на перекрестке улиц Дунтес и Упес, комплекс многоквартирных домов на улице Кайвас (всего 381 квартира), торговый центр Валмиерас и представительское здание Крайбанка в квартале Сканстес. В Литве построены торговый центр в Шяуляе, промышленное здание «ELINTA», а также здание коммерческого и жилого назначения на улице Габийос.

2008 Построен комплекс Вируской тюрьмы и офисные здания по адресу Лыытса 2 в Ülemiste City. В области инженерного строительства были сооружены водопроводные и канализационные трассы в Пярну и Пайкузе, завершены развязка движения в Пуурмани и пассажирская галерея в Таллиннском Старом порту. В плане электростроительства состоялась передача подстанций Азери и Аулепа, а также кабельной линии электростанции Вяо.
В Латвии завершен I этап строительства квартирных домов на ул. Сканстес, построен представительный отель на улице Калнциема и комплекс офисов и складов в Кекава. В области инженерного строительства закончены работы по реконструкции нескольких мостов.
В Литве было закончено строительство самого масштабного в истории АО Merko Ehitus объекта - торгового центра «Панорама» (площадь которого насчитывает 130 000 м2, включая уровни парковки). Помимо этого многие комплексы квартирных домов. В сфере инженерного строительства завершен проект обработки воды и очистки канализационных стоков четырех поселков Неринга.