1990 5. novembril toimub AS EKE Merko asutamiskoosolek. EKE Merko ostab EKE MRK varad ja kohustused.

1992 EKE Merko kolib uude peakontorisse ja tootmishoonetesse Sauel Harjumaal.

1995 EKE Merko ehitab suurima objektina uue Hansapanga peahoone Tallinnas. Ettevõte tõuseb üheks suurimaks ehitusfirmaks Eestis.

1996 Ettevõttest eraldatakse kõik ehitusega mitte-seotud tegevused. Ettevõtte uueks ärinimeks saab AS Merko Ehitus.

1997 Esmane aktsiate avalik emissioon, millele järgneb 22. juulil noteerimine Tallinna Väärtpaberibörsi põhinimekirjas. Firma aktsiatega kaubeldakse ka Müncheni ja Frankfurdi väärtpaberibörsidel.

1998 Merko Ehitus omandab enamusosalused tütarettevõtetes OÜ Matek, AS Merko Tartu, UAB Merko Statyba (100%) Leedus ja SIA Merks (100%) Lätis. Ettevõte tõuseb 843 miljoni kroonise käibega suurimaks ehitusettevõtteks Eestis ja ühtlasi ka Baltikumis.

1999 Valmivad Eesti Ühispanga peakontor ning Kristiine Kaubanduskeskus laieneb äritegevus Lätis ja Leedus. Kontsernist eraldatakse E.L.L Kinnisvara AS eesmärgiga lahutada kinnisvaraarendus ehitusest. Merko Ehitus keskendub ehituse peatöövõtu ja projektijuhtimise arendamisele ning vajalike töökohtade loomisele. Tegevust alustab insenerehitusdivisjon, mille tegevusvaldkonnaks on sadamad, jäätmekäitlusobjektid, teed, sillad, vee- ja kanalisatsioonitrassid jne. Ettevõttele omistatakse rahvusvaheline ISO 9001 kvaliteedisertifikaat.

2000 Valmivad Sikupilli kaubanduskeskus ja Radisson SAS hotell Eestis, rekonstrueeritakse Grand Palace Hotel Riias, ehitatakse õlletehas Cēsu Alus tootmishooned Lätis ja Lietuvos Telekomase peahoone Leedus. Insenerehituse valdkonnas valmivad Eestis Väätsa prügila, samuti rekonstrueeritakse Jõhvi-Ahtme veevarustussüsteem ja Kuressaare, Valga, Pärnu veepuhastusseadmed. Merko Ehituse käive ületab miljardi krooni piiri.

2001 Seoses turu nõudluse kasvuga ühepereelamute- ja korterite osas luuakse Merko Ehituses elamuehitusdivisjon. Suurematest objektidest valmivad Tuvi tänava elamud, Teelahkme peremajad. Ettevõte omandab 100%-lise osaluse Tallinna Teede AS-is, millega laiendatakse teenuste portfelli teede remondi ja projektijuhtimisega.

2002 Suurematest objektidest ehitatakse Kristiine Kaubanduskeskuse laiendus, Haabersti Citymarket ning Norde Centrum. Alustatakse Mustakivi kaubanduskeskust ja Viru väljaku kaubandus- ja ärikeskust ning Hansapanga peamaja ehitust Riias.

2003 Asutatakse tütarettevõte OÜ Gustaf Tallinn, omandatakse 100% osalus OÜs Woody; asutatakse SIA Merksi ja UAB Merko Statyba tütarettevõtted. Sõlmitakse uued suuremahulised ehituslepingud Muuga kivisöeterminali ja Eesti Kunstimuuseumi ehitamiseks Eestis. Rekonstrueeritakse Vilniuse kunagine esindushotell Lietuva.

2004 Valmivad Viru Keskus Tallinna kesklinnas, Hansabanka uus peahoone Riias. SIA Merks alustab ühe keerukaima arendusprojekti, multifunktsionaalse vabaajakeskuse Riga Arena ehitust Riias. Eestis valmivad suurematest objektidest veel Pärnu hotell-veekeskus ja hotell Tallink City.

2005 Võõrandatakse tütarettevõte OÜ Merko Kaevandused. Suurematest ehitusobjektidest valmivad Eesti Kunstimuuseum (KUMU), Rävala pst. korterelamu, Wendre tootmishoone, Muuga kivisöeterminal ning äri- ja eluhoone Admirali maja Eestis. Sõlmitakse ehituslepingud Tartu vee- ja kanalisatsioonivõrgu laiendamiseks ja rekonstrueerimiseks ja Tallinna Sadamaga Saaremaa süvasadama rajamiseks. Läti pealinnas Riias valmib Spice kaubanduskeskuse II etapp. Leedus alustatakse Šiauliai kesklinna kaubanduskeskuse ehitamisega.

2006 Aasta algul valmivad SIA Merksi ja Merko Ehituse ühiste jõupingutuste tulemusena Skanstese tänava piirkonnas 12 000-kohaline multifunktsionaalne vabaajakeskus ning alustatakse nelja 24-korruselise korterelamu arendusprojektiga. Suurematest objektidest Eestis valmivad Viimsi koolimaja, Saaremaa süvasadam, Eesti Panga büroohoone, korterelamud Tabasalu keskuses, Tallinna Prügila II ehitusjärjekord, Iru munitsipaalelamute kompleks ning Valga linna vee- ja kanalisatsioonitrassid. Alustatakse Skulte sadama ja Murjani silla ehitust. Leedus Vilniuses saavad nurgakivi kontserni kõigi aegade suuremamahulisem ehitusobjekt - Panorama kaubanduskeskus.

2007 Valmivad Sõpruse Ärimaja, Tornimäe elamu, Hotell Tallink SPA ning Nordic Hotel Forum. Elamuehituses sai valmis uus elamu Sõpruse pst-l ning lõpetati ridaelamute ja kortermajade ehituse II etapp Räägu-Kännu piirkonnas. Insenerehituse vallas valmis Smuuli tee pikendus ja Puurmani liiklussõlm. Puurmani liiklussõlme kaarsild tunnistati Eesti Betooniühingu poolt "Aasta Betoonehitis 2007" võitjaks. Lätis rekonstrueeriti I etapis Skulte Sadama Lõunamuul. Suurematest objektidest valmivad veel SPICE Kaubanduskeskuse kõrvale mööblimaja, Duntes/Upes tänavate ristmikul kaasaegne bürookompleks, Kaivase tänaval korterelamute kompleks kogumahuga 381 korterit, Valmieras kaubanduskeskus ning Krajbanka esindushoone Skanstese kvartalis. Leedus valmisid Šiauliai kaubanduskeskus, ELINTA tööstushoone ja omaarendusena äri- ja kortermaja Gabijose tänaval.

2008 Valmisid Viru Vangla kompleks ning büroohooned Lõõtsa 2 Ülemiste Citys. Insenerehituse vallas valmisid Pärnu ja Paikuse vee- ja kanalisatsioonitrassid, lõplikult Puurmani liiklussõlm ning Tallinna Vanasadamas reisijate galerii. Elektriehituse vallas anti üle Aseri ja Aulepa alajaamad ning Väo Elektrijaama kaabelliin.
Lätis valmisid Skanstese tn korterelamute I etapp, esinduslik hotell Kalnciema tänaval ning büroo- ja laokompleks Kekavas. Insenerehituse valdkonnas on rekonstrueerimistööd lõpetatud mitmel sillal.
Leedus valmis AS-i Merko Ehitus ajaloo seni suuremamahulisem objekt - Panorama kaubanduskeskus (koos parkimistasanditega 130 000 m²). Lisaks veel mitmed korterelamute kompleksid. Insenerehituse valdkonnas valmis Neringa nelja linna veetöötluse ja kanalisatsioonipuhastuse projekt.